63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2010 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  62.29 
 
 
249 aa  325  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  61.7 
 
 
242 aa  318  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  61.18 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  45.91 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  41 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  41.67 
 
 
248 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  42.26 
 
 
267 aa  182  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  36.05 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  35.62 
 
 
235 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  32.62 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  34.76 
 
 
235 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  35.91 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  29.87 
 
 
235 aa  122  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  28.16 
 
 
241 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  33.47 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  29.55 
 
 
253 aa  92  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  26.18 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  29.92 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  29.87 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  27.66 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  29.61 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  28.05 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  26.61 
 
 
246 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  29.36 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  26.97 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  27.07 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  26.53 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  29.8 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  26.27 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  27.95 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  29.02 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  30.17 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  28.44 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  27.56 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  27.92 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  27.68 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  27.55 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  27.23 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  27.16 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2273  hypothetical protein  22.88 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222464  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  22.64 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1250  protein of unknown function DUF75  23.85 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  29.11 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  23.26 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  28.9 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  24.09 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  28.04 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  25.68 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  27.27 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  24.84 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  23.7 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  25.45 
 
 
276 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  25.73 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  27.8 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  25.82 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0034  hypothetical protein  20.73 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  26.16 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2148  hypothetical protein  26.32 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1550  hypothetical protein  23.87 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4768  protein of unknown function DUF75  27.03 
 
 
181 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>