More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1977 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  852    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  62.68 
 
 
421 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  61.35 
 
 
425 aa  488  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  57.11 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  56.11 
 
 
420 aa  420  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  42.04 
 
 
420 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  38.59 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  37.88 
 
 
424 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  37.62 
 
 
424 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  40.55 
 
 
429 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  41.2 
 
 
421 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  40.96 
 
 
421 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  38.83 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  38.73 
 
 
422 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  38.2 
 
 
422 aa  278  9e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 
468 aa  270  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  36.38 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  36.41 
 
 
422 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 
417 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  36.75 
 
 
438 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  38.01 
 
 
470 aa  255  9e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  34.2 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  36.36 
 
 
434 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  36.85 
 
 
443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  37.47 
 
 
467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  38.01 
 
 
477 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  35.97 
 
 
424 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  37.47 
 
 
443 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  39.43 
 
 
430 aa  249  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 
456 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  38.54 
 
 
439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  37.29 
 
 
427 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  36.7 
 
 
447 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  36.5 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  38.38 
 
 
425 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  39.43 
 
 
464 aa  239  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  34.7 
 
 
431 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.95 
 
 
433 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  35.38 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.28 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  34.12 
 
 
433 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  37.71 
 
 
430 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.26 
 
 
447 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  33.97 
 
 
442 aa  229  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  36.34 
 
 
452 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  34.86 
 
 
426 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  35.95 
 
 
465 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  35.13 
 
 
418 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  32.67 
 
 
447 aa  224  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  32.69 
 
 
437 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  32.45 
 
 
426 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  35.71 
 
 
434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
434 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  34.41 
 
 
434 aa  222  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  33.17 
 
 
431 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  33.73 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  35 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  33.57 
 
 
445 aa  221  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 
446 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  36.47 
 
 
455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.75 
 
 
446 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.46 
 
 
442 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  36.21 
 
 
425 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  34.38 
 
 
442 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.96 
 
 
432 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  31.22 
 
 
431 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  35.14 
 
 
454 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  33.99 
 
 
442 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  32.4 
 
 
418 aa  219  8.999999999999998e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  32.52 
 
 
428 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  36.01 
 
 
423 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  36.39 
 
 
455 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  33.74 
 
 
442 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  35.06 
 
 
429 aa  217  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  33.66 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  34.01 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  34.4 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  32.81 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.25 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  32.2 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  34.78 
 
 
426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  34.57 
 
 
433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.38 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.09 
 
 
445 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  34.15 
 
 
417 aa  212  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 
464 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  34.34 
 
 
439 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  33.91 
 
 
417 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 
424 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  36.09 
 
 
445 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  36.09 
 
 
445 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  33.33 
 
 
464 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
464 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 
429 aa  209  6e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  33.17 
 
 
443 aa  209  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  30.86 
 
 
431 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>