More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1976 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
208 aa  420  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.47 
 
 
213 aa  271  7e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.66 
 
 
202 aa  262  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.69 
 
 
205 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.65 
 
 
206 aa  245  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.5 
 
 
218 aa  223  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.74 
 
 
203 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.78 
 
 
202 aa  222  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.59 
 
 
202 aa  221  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.5 
 
 
205 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.79 
 
 
206 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
206 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.28 
 
 
204 aa  208  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.55 
 
 
204 aa  207  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.53 
 
 
206 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.71 
 
 
225 aa  205  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.2 
 
 
225 aa  204  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.22 
 
 
225 aa  204  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.75 
 
 
211 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.48 
 
 
206 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.26 
 
 
205 aa  201  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.98 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.24 
 
 
220 aa  198  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.55 
 
 
205 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.75 
 
 
214 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.18 
 
 
200 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.48 
 
 
213 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
209 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.32 
 
 
224 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.84 
 
 
214 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.03 
 
 
212 aa  188  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.03 
 
 
212 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.03 
 
 
212 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.94 
 
 
313 aa  187  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.72 
 
 
209 aa  187  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
215 aa  187  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
219 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.94 
 
 
222 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.98 
 
 
229 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.49 
 
 
218 aa  185  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
209 aa  184  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.97 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.7 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
212 aa  181  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.45 
 
 
227 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.84 
 
 
220 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2513  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.8 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114714 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.85 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.56 
 
 
217 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.03 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
221 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.03 
 
 
217 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.24 
 
 
205 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.08 
 
 
218 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.72 
 
 
217 aa  175  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.56 
 
 
212 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.96 
 
 
225 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
216 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
216 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.8 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.92 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.34 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.18 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.71 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.65 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.86 
 
 
187 aa  171  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.92 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.06 
 
 
197 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.1 
 
 
214 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.92 
 
 
226 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
216 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.33 
 
 
222 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.06 
 
 
229 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
213 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
222 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.23 
 
 
225 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.84 
 
 
212 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
203 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.88 
 
 
223 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
217 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
224 aa  167  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.16 
 
 
188 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.1 
 
 
221 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
202 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
220 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49 
 
 
228 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
213 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
222 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.8 
 
 
216 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.38 
 
 
222 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.3 
 
 
186 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
215 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
223 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>