More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1955 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  50.78 
 
 
263 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  47.33 
 
 
263 aa  259  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  47.33 
 
 
263 aa  259  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  47.33 
 
 
263 aa  259  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  45.21 
 
 
263 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  47.29 
 
 
258 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  37.02 
 
 
258 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
262 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.17 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  37.35 
 
 
246 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
253 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
268 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
255 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  29.62 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  35.66 
 
 
258 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  36.4 
 
 
337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.32 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 
247 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.84 
 
 
251 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
262 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.4 
 
 
259 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  30.41 
 
 
263 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
252 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.3 
 
 
258 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
257 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.33 
 
 
254 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 
260 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.31 
 
 
258 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.38 
 
 
253 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.94 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.69 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.61 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.36 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.71 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  31.03 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  34.62 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  36.92 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.99 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.26 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  33.09 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.66 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.31 
 
 
268 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
270 aa  89  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.56 
 
 
252 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.85 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.12 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.85 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.73 
 
 
256 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.17 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.91 
 
 
253 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  28.2 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.61 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.82 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.46 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.65 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.82 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.9 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.09 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.1 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.47 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.13 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.32 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  39.55 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  32.39 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.2 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  31.91 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.59 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.07 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.54 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.63 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.77 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.51 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.68 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.68 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.58 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.58 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.2 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.94 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.65 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>