More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1939 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  30.52 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  33.11 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.87 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  32.65 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.64 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.99 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  30.3 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  31.17 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.55 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  32.24 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  28.4 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.08 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  31.37 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  29.14 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  29.61 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  32.24 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.08 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.67 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  31.45 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.86 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.77 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  29.53 
 
 		 278 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.73 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  32.12 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  31.54 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.29 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  41.3 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  38.46 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.38 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.86 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.86 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  32.68 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  28.66 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  33.11 
 
 		 289 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.21 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.21 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  28.03 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  30.38 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  29.14 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.33 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.22 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  25.79 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  34.42 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.25 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.41 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.52 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.45 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  26.49 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.52 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  29.68 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  32.81 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  28.48 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  28.48 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.49 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.39 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.39 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.57 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  28.03 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.54 
 
 		 303 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.48 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  28.57 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  25.31 
 
 		 182 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  25.31 
 
 		 182 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  29.73 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.67 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.87 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  29.03 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.73 
 
 		 300 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.13 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  27.81 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  30.61 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.56 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>