More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1922 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  70.65 
 
 		 292 aa  427  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  67.81 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  62.33 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  60.07 
 
 		 292 aa  353  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  48.26 
 
 		 291 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  47.39 
 
 		 291 aa  281  9e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  43.49 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  42.01 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  37 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  37.67 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  36.67 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  37.33 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  33.67 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  47.09 
 
 		 177 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  35.49 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  47.43 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  45.35 
 
 		 177 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  45.93 
 
 		 177 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  43.43 
 
 		 177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  44.19 
 
 		 177 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  31.23 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  38.18 
 
 		 173 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  30.69 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  34.55 
 
 		 176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  40.27 
 
 		 178 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  30.93 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  30.14 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  34.36 
 
 		 194 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  30.03 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  29.51 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  33.91 
 
 		 897 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.79 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  35.2 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.61 
 
 		 877 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.62 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.57 
 
 		 909 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.43 
 
 		 907 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 885 aa  62.4  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  30.95 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 138 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.27 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  26.19 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.15 
 
 		 1560 aa  58.9  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  30.94 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  29.73 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.83 
 
 		 873 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.87 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  32.79 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  35.04 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.61 
 
 		 877 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 873 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.41 
 
 		 862 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 863 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  39.64 
 
 		 603 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 		 873 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.53 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.34 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.69 
 
 		 600 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.51 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  30.65 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  28.07 
 
 		 432 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.91 
 
 		 867 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 141 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.3 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.57 
 
 		 845 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  32.09 
 
 		 904 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.58 
 
 		 907 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 		 698 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.85 
 
 		 903 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  33.08 
 
 		 138 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 162 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.15 
 
 		 155 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  30.65 
 
 		 413 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 142 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  30.87 
 
 		 158 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.58 
 
 		 688 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  30.4 
 
 		 865 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.15 
 
 		 769 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.74 
 
 		 863 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.57 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.36 
 
 		 606 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  26.15 
 
 		 132 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>