More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1898 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  54.41 
 
 
149 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  57.46 
 
 
138 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 
146 aa  138  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  41.79 
 
 
138 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  34.75 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  34.75 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.75 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  36.97 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  36.79 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  29.17 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  38.04 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  32.26 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  27.5 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.48 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  33 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  39.29 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  31.52 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.19 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  25.83 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  31.09 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  29.47 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30.51 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.97 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 
209 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  30.83 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
232 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  24.46 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.17 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.43 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  29 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  29.13 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
191 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  29 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  29 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  29 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  30.39 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  30.39 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  27.35 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.82 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  30.39 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.37 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.45 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
213 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  32.04 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  34.67 
 
 
151 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  28 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
154 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  27.88 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  30.25 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  30.25 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  25 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  25.24 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>