86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1871 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 317 aa  651    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  34.27 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.13 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  28.16 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  27.22 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 384 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  27.21 
 
 		 375 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 		 375 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  26.28 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.1 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.42 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.5 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  25.87 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.1 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  25.48 
 
 		 376 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  28.97 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.35 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  28.72 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  23.51 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  27.65 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  23.82 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  24.32 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  24.32 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  23.18 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  23.55 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  23.99 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  24.36 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  27.76 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 534 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0067  hypothetical protein  31.86 
 
 		 186 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 187 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  24.65 
 
 		 535 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 487 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0550  phosphodiesterase  27.75 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1808  hypothetical protein  29.55 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2991  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0913946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  24.19 
 
 		 535 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  31.2 
 
 		 515 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 504 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 512 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>