More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1848 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  100 
 
 		 365 aa  746    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  67.49 
 
 		 363 aa  511  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  67.67 
 
 		 365 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  64.38 
 
 		 365 aa  487  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  62.53 
 
 		 369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  44.8 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  46.39 
 
 		 395 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  47.97 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  47.13 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  46.57 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  40.37 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  40.63 
 
 		 384 aa  285  7e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  40.11 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  44.41 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  39.25 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  41.55 
 
 		 384 aa  275  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  43.84 
 
 		 349 aa  275  9e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  44.89 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.84 
 
 		 403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.12 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.37 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.93 
 
 		 498 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.01 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.07 
 
 		 514 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.94 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.74 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  30.37 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.83 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.46 
 
 		 513 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.78 
 
 		 478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.67 
 
 		 500 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.08 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  29.43 
 
 		 546 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.42 
 
 		 494 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  31.68 
 
 		 473 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.88 
 
 		 499 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  34.26 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  30.67 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  30.67 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.46 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  30.54 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  30.67 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  31.27 
 
 		 473 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  30.3 
 
 		 473 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  30.3 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87778  dihydrosphingosine-1-phosphate lyase  29.17 
 
 		 603 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  33.33 
 
 		 572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.76 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1640  glutamate decarboxylase  29.03 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  25.41 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  29.06 
 
 		 605 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  27.89 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  29.63 
 
 		 605 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.84 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.67 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  27.83 
 
 		 461 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0149  glutamate decarboxylase  27.48 
 
 		 496 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.283505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5339  glutamate decarboxylase  27.71 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13469  glutamate decarboxylase gadB  30.26 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.294595  hitchhiker  0.000990947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  29.41 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1145  glutamate decarboxylase  29.41 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  29.41 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.81 
 
 		 464 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1483  glutamate decarboxylase  28.14 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2691  glutamate decarboxylase  25 
 
 		 489 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0236488  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03700  glutamate decarboxylase, putative  27.27 
 
 		 557 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03700  glutamate decarboxylase, putative  27.27 
 
 		 557 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  26.56 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.48 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  28.57 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4935  glutamate decarboxylase  27.25 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2315  glutamate decarboxylase  26.11 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03063  glutamate decarboxylase  29.12 
 
 		 464 aa  99.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  30.56 
 
 		 464 aa  99.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4739  glutamate decarboxylase  30.21 
 
 		 464 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  31.6 
 
 		 473 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  31.58 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8660  glutamate decarboxylase  29.59 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.99 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1197  glutamate decarboxylase beta  30.56 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0045  glutamate decarboxylase  26.48 
 
 		 468 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2029  glutamate decarboxylase  29.17 
 
 		 466 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18041  glutamate decarboxylase  27.6 
 
 		 479 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.171895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.81 
 
 		 516 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1637  histidine decarboxylase  28.37 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2341  glutamate decarboxylase  24.73 
 
 		 466 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0367356  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4374  glutamate decarboxylase  28.07 
 
 		 466 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  26.91 
 
 		 460 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  25.46 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40180  Glutamate decarboxylase (GAD) (ERT D1)  25.35 
 
 		 569 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3826  glutamate decarboxylase  27.3 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0551  glutamate decarboxylase  27.22 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  27.24 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.52 
 
 		 461 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  30.22 
 
 		 470 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.05 
 
 		 789 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.19 
 
 		 517 aa  89.4  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  24.83 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.73 
 
 		 503 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07278  glutamate decarboxylase (Eurofung)  24.28 
 
 		 521 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>