More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1794 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  63.64 
 
 		 187 aa  244  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  62.57 
 
 		 188 aa  236  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  54.79 
 
 		 188 aa  218  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  39.64 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  34.92 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.18 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  32.22 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  31.82 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  28.42 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.83 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  36.67 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  28.44 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  32.7 
 
 		 615 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  40.87 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 615 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  36.07 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.26 
 
 		 606 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 		 620 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  31.53 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.09 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  36.3 
 
 		 411 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.34 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  34.48 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  31.65 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1599  CBS domain containing protein  28.64 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  31.65 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.65 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  33.57 
 
 		 620 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  33.57 
 
 		 620 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  32.24 
 
 		 629 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 615 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.09 
 
 		 478 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 615 aa  72  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  32.86 
 
 		 620 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.94 
 
 		 615 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  32.82 
 
 		 399 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31.85 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  38.26 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  33.83 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  29.09 
 
 		 627 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  38.1 
 
 		 648 aa  69.7  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  34.82 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  33.57 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  29.86 
 
 		 629 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  29.5 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  31.97 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  34.35 
 
 		 413 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  31.67 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.28 
 
 		 613 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  35.29 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  31.09 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  32.8 
 
 		 613 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  31.71 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.25 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  34.56 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  30.34 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  27.63 
 
 		 626 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 		 600 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 611 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  30.43 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.6 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  30.25 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  37 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  30.94 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  32.82 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  32.06 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>