56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1781 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  683    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  56.08 
 
 
338 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  54.3 
 
 
352 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  45 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  44.96 
 
 
347 aa  293  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  43.39 
 
 
366 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  41.23 
 
 
347 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  36.6 
 
 
348 aa  222  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  36.98 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  38.3 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  34.03 
 
 
344 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  29.64 
 
 
340 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  30.88 
 
 
342 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  35.33 
 
 
357 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  27.41 
 
 
340 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  29.18 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.98 
 
 
352 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  25.64 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  25.21 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  25 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  21.89 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  27.03 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.66 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  26.09 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  25.95 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  26.43 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.02 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  21.66 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  25.94 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  21.97 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  24.38 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  24.38 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  27 
 
 
432 aa  57  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  26.78 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  23.74 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  25.43 
 
 
281 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  24.49 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  24.66 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  25.69 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  25.48 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  26.26 
 
 
321 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  23.72 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  23.36 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  23.51 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  23.78 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  21.78 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.82 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  25.57 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  26.82 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  25.29 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  26.21 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  23.87 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  25.44 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  23.7 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0733  hypothetical protein  26.5 
 
 
350 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.97575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>