More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1760 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
527 aa  1050    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  60.63 
 
 
656 aa  664    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.95 
 
 
550 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.99 
 
 
532 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.72 
 
 
531 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  54.56 
 
 
572 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.02 
 
 
527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.61 
 
 
527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.5 
 
 
565 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.01 
 
 
595 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.62 
 
 
532 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.61 
 
 
530 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  48.82 
 
 
531 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.63 
 
 
643 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.96 
 
 
539 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.14 
 
 
541 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 
533 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.63 
 
 
532 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.47 
 
 
590 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.72 
 
 
550 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.63 
 
 
594 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.41 
 
 
528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.41 
 
 
528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.8 
 
 
584 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.15 
 
 
525 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  52.15 
 
 
528 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  52.15 
 
 
525 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.15 
 
 
511 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.39 
 
 
538 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  51.91 
 
 
529 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  52.15 
 
 
533 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.15 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  52.15 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.02 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.15 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  52.15 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
482 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  50.35 
 
 
580 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.5 
 
 
594 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.31 
 
 
466 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  42.88 
 
 
589 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  40.92 
 
 
574 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.39 
 
 
541 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  42.19 
 
 
579 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.07 
 
 
589 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.02 
 
 
546 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.65 
 
 
546 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  41.89 
 
 
601 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.46 
 
 
597 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  45.42 
 
 
530 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.34 
 
 
602 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.9 
 
 
529 aa  419  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.93 
 
 
474 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.8 
 
 
637 aa  422  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.37 
 
 
599 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.84 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.44 
 
 
607 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.72 
 
 
562 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  44.61 
 
 
561 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.84 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.54 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.35 
 
 
747 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.84 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.31 
 
 
610 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  43.99 
 
 
590 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.58 
 
 
595 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.21 
 
 
564 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.49 
 
 
561 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.21 
 
 
694 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.93 
 
 
605 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  43.21 
 
 
583 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.68 
 
 
731 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.44 
 
 
611 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  49.41 
 
 
485 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  42.05 
 
 
609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.05 
 
 
609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
640 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.07 
 
 
610 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.77 
 
 
640 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.04 
 
 
608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.79 
 
 
606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.79 
 
 
646 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
640 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.92 
 
 
622 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.51 
 
 
634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.32 
 
 
599 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.13 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
640 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.11 
 
 
591 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
640 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.85 
 
 
623 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.92 
 
 
622 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.63 
 
 
677 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.78 
 
 
657 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.54 
 
 
629 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.14 
 
 
621 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.22 
 
 
653 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  40.54 
 
 
629 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.54 
 
 
651 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>