166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1719 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.26 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  44.36 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  46.77 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  41.45 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  40.79 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  41.48 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  41.84 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  45.11 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  43.75 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  41.84 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  44.35 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  41.73 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.73 
 
 		 558 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  42.4 
 
 		 161 aa  101  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  41.94 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  39.19 
 
 		 279 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  41.98 
 
 		 596 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  40.16 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  45.37 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.4 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  43.55 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.55 
 
 		 141 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  45.24 
 
 		 160 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  37.85 
 
 		 337 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  35.63 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  37.64 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  38.93 
 
 		 140 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  42.45 
 
 		 162 aa  94.7  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 160 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 		 156 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  32.07 
 
 		 272 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 		 238 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 		 156 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  46.3 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  38.64 
 
 		 141 aa  92  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  40.62 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  41.41 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  38.56 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  42.75 
 
 		 133 aa  90.1  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 		 133 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  41.22 
 
 		 133 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.29 
 
 		 308 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.88 
 
 		 139 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  40.16 
 
 		 151 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  35.76 
 
 		 301 aa  89  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  41.41 
 
 		 186 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 134 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 157 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  36.96 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 		 157 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  35.25 
 
 		 134 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  31.71 
 
 		 135 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 		 133 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 		 133 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  40.8 
 
 		 178 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0021  beta-Ig-H3/fasciclin  39.39 
 
 		 141 aa  85.5  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  42.34 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  35.97 
 
 		 142 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  38.84 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  34.03 
 
 		 611 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  36.88 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  30.39 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  38.81 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  35.56 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  38.02 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  38.84 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  36.8 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  33.59 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  34.57 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  37.16 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  39.06 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.76 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  39.06 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  35.94 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  36.89 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  32.52 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  38.76 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  36.72 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  38.28 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  42.97 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  36.07 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  32.26 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  35.16 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0278  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216669  normal  0.0952762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  32.32 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  36.62 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  36.62 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  33.53 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  36.96 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  34 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  35.38 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>