More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1711 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
365 aa  721  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  35 
 
 
396 aa  197  2e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  34.79 
 
 
396 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  36.29 
 
 
406 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  36.89 
 
 
381 aa  167  3e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 
390 aa  163  5e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  35.01 
 
 
386 aa  163  5e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  38.79 
 
 
341 aa  162  8e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  30.53 
 
 
391 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  31.39 
 
 
390 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  36.6 
 
 
391 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  31.48 
 
 
390 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  37.82 
 
 
407 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 
390 aa  147  4e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  33.62 
 
 
408 aa  146  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  35.71 
 
 
399 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 
399 aa  136  6e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  34.8 
 
 
395 aa  132  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 
375 aa  131  2e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  31.55 
 
 
387 aa  128  1e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 
360 aa  128  2e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 
348 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  33.82 
 
 
398 aa  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  34.4 
 
 
397 aa  122  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  34.64 
 
 
363 aa  121  2e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  33.81 
 
 
398 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  30.61 
 
 
416 aa  119  8e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 
380 aa  117  4e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 
380 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  31.06 
 
 
379 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  32.2 
 
 
380 aa  112  8e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  30.9 
 
 
380 aa  110  4e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  29.54 
 
 
379 aa  109  8e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  32.1 
 
 
382 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 
402 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 
380 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  33.92 
 
 
424 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 
376 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 
396 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  35.15 
 
 
353 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  7.12182e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  35.15 
 
 
353 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
393 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
399 aa  99.4  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  31.4 
 
 
384 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  27.71 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.3 
 
 
378 aa  96.3  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  29.6 
 
 
401 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  26.87 
 
 
379 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 
398 aa  92.8  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 
452 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.63 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.64 
 
 
425 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 
384 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  30.08 
 
 
411 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  32.28 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  31.67 
 
 
418 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.99 
 
 
376 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  31.17 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
374 aa  85.9  1e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 
393 aa  84.7  2e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  32.09 
 
 
360 aa  85.1  2e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 
369 aa  84  4e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30.35 
 
 
435 aa  83.6  5e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 
393 aa  83.2  7e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
357 aa  82.8  9e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  35.42 
 
 
403 aa  82.4  1e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 
421 aa  82.4  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
385 aa  82  1e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
375 aa  82.4  1e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 
459 aa  81.6  2e-14  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.15 
 
 
389 aa  80.5  4e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 
403 aa  80.5  5e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  22.5 
 
 
391 aa  80.1  5e-14  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 
453 aa  79  1e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  6.84168e-06 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 
385 aa  77.8  3e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 
362 aa  77.4  4e-13  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.87 
 
 
368 aa  77.4  4e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  29.07 
 
 
429 aa  77  5e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 
453 aa  76.6  6e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 
362 aa  76.6  7e-13  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 
458 aa  76.6  7e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 
385 aa  75.5  1e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  28 
 
 
406 aa  75.9  1e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 
434 aa  75.9  1e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 
406 aa  75.1  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.3 
 
 
394 aa  74.3  3e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 
394 aa  74.3  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  28.62 
 
 
429 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  28.62 
 
 
429 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 
398 aa  74.7  3e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.62 
 
 
429 aa  73.9  4e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 
386 aa  73.9  4e-12  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.81 
 
 
445 aa  73.9  4e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  23.2 
 
 
392 aa  73.6  5e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>