177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1697 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  100 
 
 
279 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  52.33 
 
 
281 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  56.99 
 
 
279 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  51.25 
 
 
282 aa  259  4e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  48.57 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  39.16 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  41.39 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  39.02 
 
 
289 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  37.21 
 
 
279 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  36.11 
 
 
278 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.34 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.09 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  36.51 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  39.82 
 
 
282 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  36.71 
 
 
284 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  35.64 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  36.82 
 
 
284 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  41.9 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  34 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  31.02 
 
 
283 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  37.5 
 
 
275 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  30.91 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  34.3 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  36.55 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  31.67 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  29.55 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  35.6 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  29.9 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  31.96 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  29.47 
 
 
293 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  30.04 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  32.22 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  38.22 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.76 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.46 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  26.86 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  29.89 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.33 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  31.79 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  32.34 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.79 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.93 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  29.61 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.49 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.47 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.43 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.21 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  31.03 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.12 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.06 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  30.39 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  28.46 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.21 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.71 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.88 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  28.19 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.57 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.27 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.27 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.27 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.86 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  29.47 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  30.15 
 
 
334 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  28.19 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.48 
 
 
332 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.29 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  26.54 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.9 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.27 
 
 
317 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.73 
 
 
333 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.9 
 
 
330 aa  62.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.21 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  35.03 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.22 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  29.38 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  30.51 
 
 
423 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  30.54 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  26.29 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  30.57 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  25.1 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.19 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  26.78 
 
 
349 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  27.08 
 
 
335 aa  58.9  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  27.45 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.65 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.49 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  25.94 
 
 
336 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  29.41 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  31.1 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.91 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  43.04 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  23.45 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  27.61 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  28.79 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  25 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.75 
 
 
304 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.4 
 
 
297 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>