39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1695 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  477  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  59.32 
 
 
237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  54.71 
 
 
232 aa  264  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  52.8 
 
 
230 aa  245  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  48.43 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  34.23 
 
 
208 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  27.89 
 
 
211 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  29.81 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  33.57 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  32.14 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  36.7 
 
 
214 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  38.53 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  27.5 
 
 
211 aa  92  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  27.84 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  31.9 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  24.44 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  30.52 
 
 
634 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  24.75 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  27.71 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  27.13 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  29.37 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  22.56 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  30.63 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  26.74 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  27.17 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  24.83 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  27.72 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  23.83 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  27.59 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  23.68 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  25.85 
 
 
307 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  25.18 
 
 
298 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  22.97 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  22.89 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  24.34 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  24.17 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>