49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1685 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  64.1 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  63.06 
 
 		 159 aa  193  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  62.25 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  48 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  52.74 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  52.82 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  49.1 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  49.66 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  43.54 
 
 		 606 aa  116  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  42.21 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  37.84 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  45.89 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  43.15 
 
 		 172 aa  98.2  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.6 
 
 		 649 aa  97.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.93 
 
 		 649 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.26 
 
 		 649 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.58 
 
 		 649 aa  92.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.57 
 
 		 652 aa  87.4  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  37.34 
 
 		 615 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  35.46 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  36.81 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  33.8 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  37.58 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.55 
 
 		 582 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  35.06 
 
 		 600 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.93 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.17 
 
 		 608 aa  54.3  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  28.48 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  42.86 
 
 		 546 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  27.59 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  26.47 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  44.44 
 
 		 546 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  36 
 
 		 590 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  37.5 
 
 		 541 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  34.21 
 
 		 634 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  37.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  31.69 
 
 		 497 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  37.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  30.95 
 
 		 544 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  36.14 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  36.14 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.33 
 
 		 580 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  30.43 
 
 		 633 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  34.29 
 
 		 158 aa  42  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  43.48 
 
 		 538 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  43.48 
 
 		 538 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>