132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1667 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  641    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  59.25 
 
 		 298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  54.46 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  54.87 
 
 		 313 aa  332  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  53.47 
 
 		 305 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  54.18 
 
 		 301 aa  309  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  48.17 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  50.66 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  51.84 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  51.16 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  46 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  47.51 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  46.84 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  49.51 
 
 		 323 aa  288  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  46.86 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  47.52 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  45.85 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  47.37 
 
 		 309 aa  265  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  43.85 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  46.99 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  43.83 
 
 		 334 aa  257  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  46.1 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  40.28 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  45.04 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 		 286 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  43.56 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  42.05 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  41.24 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  41.15 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  38.63 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  40.16 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  33.57 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  33.2 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  31.21 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  28.2 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 376 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 365 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  23.86 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 405 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  27.11 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  25.84 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  32.75 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  33.88 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  23.86 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  24.56 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  23.94 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.44 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  24.58 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  24.91 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.32 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.19 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>