59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1659 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 
216 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  63.26 
 
 
216 aa  308  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  57.41 
 
 
216 aa  271  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  58.71 
 
 
200 aa  254  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  43.32 
 
 
220 aa  188  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45.77 
 
 
225 aa  166  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  43.78 
 
 
223 aa  165  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45.15 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  40.27 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.6 
 
 
242 aa  156  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  39.19 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.43 
 
 
235 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  38.91 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  36.07 
 
 
223 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  39.37 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  37.1 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  33.79 
 
 
223 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  32.42 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.96 
 
 
223 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  28.64 
 
 
222 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  33.03 
 
 
225 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  33.33 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  35.51 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  32.82 
 
 
226 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  34.39 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  32.31 
 
 
226 aa  92  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.55 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  31.79 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.88 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  35.68 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  33.64 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.1 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  30.64 
 
 
244 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  32.7 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.38 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  33.18 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.6 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  33.18 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  30.2 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  28.91 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  32.86 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.9 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.11 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  30.52 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.65 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  33.33 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.05 
 
 
223 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.52 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.06 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  28.92 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  33.58 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.38 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.57 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.91 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  26.54 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.4 
 
 
230 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  21.33 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>