169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1647 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  100 
 
 
169 aa  320  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  55.21 
 
 
178 aa  174  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  54.17 
 
 
169 aa  174  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  52.07 
 
 
169 aa  161  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  50.92 
 
 
176 aa  158  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  40.94 
 
 
187 aa  115  2e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  46.63 
 
 
169 aa  113  1e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  46.63 
 
 
169 aa  113  1e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  41.98 
 
 
187 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  37.5 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  41.98 
 
 
189 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  36.09 
 
 
194 aa  89  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  39.24 
 
 
197 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  36.81 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  40.69 
 
 
192 aa  84.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  38.57 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  36.75 
 
 
171 aa  84  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  43.03 
 
 
182 aa  81.3  5e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  35.88 
 
 
182 aa  80.5  9e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  40.49 
 
 
188 aa  80.1  1e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  40.69 
 
 
197 aa  80.1  1e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  40.28 
 
 
195 aa  80.5  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  41.61 
 
 
175 aa  80.5  1e-14  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  41.61 
 
 
199 aa  79.7  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  36.3 
 
 
184 aa  79  3e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  41.51 
 
 
199 aa  79  3e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  39.71 
 
 
205 aa  78.6  4e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.29 
 
 
179 aa  78.6  4e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.87 
 
 
189 aa  78.6  4e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  41.43 
 
 
206 aa  77.4  8e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  37.13 
 
 
197 aa  77.4  9e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  33.54 
 
 
184 aa  76.6  2e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  39.02 
 
 
182 aa  76.3  2e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  40.41 
 
 
203 aa  75.5  3e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.55 
 
 
182 aa  75.5  3e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  35.58 
 
 
182 aa  74.7  6e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  43.17 
 
 
180 aa  74.3  7e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  36.9 
 
 
174 aa  73.2  1e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36.88 
 
 
207 aa  73.6  1e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  40.19 
 
 
212 aa  72.8  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  41.07 
 
 
198 aa  72.4  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  36.3 
 
 
165 aa  73.2  2e-12  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  39.02 
 
 
197 aa  73.2  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  38.6 
 
 
205 aa  72.4  3e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  39.32 
 
 
197 aa  72  3e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  41.32 
 
 
193 aa  72  4e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  39.02 
 
 
197 aa  71.6  4e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.57 
 
 
187 aa  71.6  5e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  38.21 
 
 
197 aa  71.2  6e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  38.21 
 
 
197 aa  71.2  6e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.12597e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  38.21 
 
 
197 aa  71.2  6e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  3.60294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  38.21 
 
 
197 aa  71.2  6e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  39.13 
 
 
197 aa  71.2  6e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  38.21 
 
 
197 aa  71.2  6e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  32.94 
 
 
197 aa  71.2  7e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  37.93 
 
 
187 aa  71.2  7e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  37.72 
 
 
190 aa  70.9  7e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  37.25 
 
 
187 aa  71.2  7e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  38.6 
 
 
190 aa  70.9  8e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  70.9  9e-12  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  36.78 
 
 
197 aa  70.9  9e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  40.38 
 
 
197 aa  70.1  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.01818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  40 
 
 
189 aa  68.9  3e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  41.21 
 
 
193 aa  68.6  4e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  41.57 
 
 
193 aa  68.2  5e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  50 
 
 
203 aa  68.2  6e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.63296e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  51.28 
 
 
208 aa  67.8  7e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  38.24 
 
 
187 aa  67.8  7e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  36.36 
 
 
210 aa  67.8  7e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  38.06 
 
 
191 aa  67.4  9e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  38.06 
 
 
191 aa  67.4  9e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  37.42 
 
 
191 aa  66.6  1e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  36.08 
 
 
196 aa  66.6  1e-10  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  36.6 
 
 
205 aa  65.9  2e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.97 
 
 
215 aa  65.9  3e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.44147e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  38.04 
 
 
231 aa  65.1  4e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  37.41 
 
 
190 aa  65.5  4e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.21582e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  34.36 
 
 
215 aa  65.1  5e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  35.12 
 
 
184 aa  65.1  5e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  37.78 
 
 
202 aa  64.7  5e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.12957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  38.46 
 
 
200 aa  64.7  5e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35.03 
 
 
204 aa  64.3  7e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  37.6 
 
 
201 aa  64.3  8e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  38.46 
 
 
197 aa  64.3  8e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.68 
 
 
189 aa  63.5  1e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  35.9 
 
 
216 aa  63.9  1e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  36.48 
 
 
199 aa  63.9  1e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  35.1 
 
 
195 aa  63.9  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  40.18 
 
 
188 aa  62.8  2e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.91401e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  37.66 
 
 
199 aa  63.2  2e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  35.81 
 
 
182 aa  63.2  2e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  40.54 
 
 
201 aa  62.4  3e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.3 
 
 
185 aa  62.4  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  42.55 
 
 
192 aa  62.4  3e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  31.58 
 
 
179 aa  61.6  5e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  42.72 
 
 
189 aa  60.8  9e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.35 
 
 
216 aa  60.5  1e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  40.62 
 
 
180 aa  60.1  1e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  46.15 
 
 
224 aa  60.1  2e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  31.18 
 
 
180 aa  60.1  2e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>