22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1576 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1576  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1724  hypothetical protein  77.55 
 
 
196 aa  309  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0708  hypothetical protein  67.88 
 
 
195 aa  268  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.117137  normal  0.791979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2622  hypothetical protein  62.76 
 
 
196 aa  259  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2076  Protein of unknown function DUF1867  68.37 
 
 
196 aa  236  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0927  hypothetical protein  43.59 
 
 
197 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1087  hypothetical protein  45.08 
 
 
195 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0726  hypothetical protein  41.45 
 
 
198 aa  147  7e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.655013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0016  hypothetical protein  41.36 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2132  hypothetical protein  42.25 
 
 
181 aa  145  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.713165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0152  hypothetical protein  43.46 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.488575  normal  0.0139746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1750  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0712  hypothetical protein  42.41 
 
 
196 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1389  Protein of unknown function DUF1867  42.47 
 
 
181 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000416753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0042  hypothetical protein  41.3 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2514  hypothetical protein  40.11 
 
 
184 aa  134  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.235466  normal  0.0113167 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0042  hypothetical protein  40.22 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.175316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1177  hypothetical protein  38.17 
 
 
185 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1252  hypothetical protein  37.7 
 
 
185 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1128  hypothetical protein  36.6 
 
 
194 aa  120  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0266635  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1542  hypothetical protein  37.8 
 
 
255 aa  91.7  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0888  putative cytoplasmic protein  32.97 
 
 
196 aa  91.3  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>