More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1544 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  100 
 
 		 159 aa  313  6e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  62.34 
 
 		 170 aa  194  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  58.39 
 
 		 907 aa  169  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  47.74 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  41.61 
 
 		 779 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  41.94 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  41.33 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  41.61 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  41.56 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  40.27 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  41.56 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  42.21 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  38.85 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  39.02 
 
 		 201 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  41.45 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  41.18 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  34.62 
 
 		 200 aa  97.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  45.45 
 
 		 179 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  42.19 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  32.91 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  36.55 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.53 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  39.2 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  35.71 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  36.05 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.53 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.53 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.53 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.66 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.81 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.94 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.42 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  39.19 
 
 		 518 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.62 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.89 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  32.88 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  31.76 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.94 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.67 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  32.64 
 
 		 568 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  32.64 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  36.36 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  32.64 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  35.48 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.27 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  34.67 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  32.21 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.99 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  35.37 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.12 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  34.4 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  39.42 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  36.11 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  39.42 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  34.15 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  34.15 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  40.82 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  36.11 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  36.11 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.89 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  34.43 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  34.27 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  30.87 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.17 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.51 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  31.75 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.76 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.86 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  30.89 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  29.25 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  35.1 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  29.05 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.8 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  34.38 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  29.14 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.6 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.06 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  39.6 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  39.6 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  30.08 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  32.88 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  39.6 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  34.38 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  32.88 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  38.61 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.69 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  36.07 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.86 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  30.72 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  31.71 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  32.67 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  32.89 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  37.82 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.1 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.89 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>