27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1524 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  58.96 
 
 
173 aa  219  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  56.73 
 
 
173 aa  202  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  57.89 
 
 
173 aa  200  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  45.45 
 
 
211 aa  186  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  43.03 
 
 
167 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  40.83 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  40.74 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  39.13 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.87 
 
 
179 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  38.46 
 
 
174 aa  120  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  39.64 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.87 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  31.55 
 
 
185 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  31.93 
 
 
185 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  31.93 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  30.95 
 
 
185 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  30.59 
 
 
183 aa  102  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  36.36 
 
 
171 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  38.06 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.933385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.92 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.51 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.56 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.24 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  22.81 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  21.93 
 
 
170 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  20.45 
 
 
170 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>