31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1500 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  628  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  54.75 
 
 
319 aa  325  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  34.42 
 
 
310 aa  175  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  31.79 
 
 
319 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  32.57 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  31.32 
 
 
319 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  31.38 
 
 
329 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  29.17 
 
 
316 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  29.69 
 
 
298 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  28.29 
 
 
397 aa  92.4  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  25.45 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  22.74 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  22.74 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0370  nucleoside recognition domain-containing protein  30.23 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.270899  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  24.72 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  28.57 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  22.94 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  23.72 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  28 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  29.65 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  22.22 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  23.37 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  22.3 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  29.01 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23.05 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  27.82 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  25.94 
 
 
457 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  31.09 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  28.5 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0110  hypothetical protein  24.88 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  22.39 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>