95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1487 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  730    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  73.65 
 
 		 343 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  63.45 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  64.29 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  59.88 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  61.09 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  63.14 
 
 		 344 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  58.73 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  57.47 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  56.45 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  56.9 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  58.91 
 
 		 355 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  58.91 
 
 		 355 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  56.36 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  55.09 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  56.08 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  56.08 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  57.5 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  57.19 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  51.93 
 
 		 350 aa  359  4e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  52.89 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  56.17 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  51.37 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  49.09 
 
 		 342 aa  332  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  48.04 
 
 		 332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  49.23 
 
 		 333 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  46.5 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  48.62 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  50 
 
 		 369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  46.61 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  47.79 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  45.18 
 
 		 345 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  45.59 
 
 		 345 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  47.65 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  48.22 
 
 		 342 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  45.9 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  45.14 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  45.75 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  47.57 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  45.12 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  45.66 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  42.95 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  46.28 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  41.82 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  42.86 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  42.01 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  41.53 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  43.79 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  44.34 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  52.38 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  41.5 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  44.63 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  38.64 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  40.55 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  45.88 
 
 		 281 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  39.8 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  40.66 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  44.44 
 
 		 256 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  35.23 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  59.02 
 
 		 144 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  52.89 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  53.23 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  47.73 
 
 		 141 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  49.61 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  53.91 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  44.22 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  46.34 
 
 		 210 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  46.72 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  46.72 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  46.09 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  49.57 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  44.72 
 
 		 197 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  45.16 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  39.33 
 
 		 192 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  48.57 
 
 		 327 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  47.01 
 
 		 127 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  34.91 
 
 		 324 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  34.91 
 
 		 324 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  56.84 
 
 		 105 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  40.32 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  45.22 
 
 		 126 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  42.73 
 
 		 154 aa  99.8  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  38.84 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  43.36 
 
 		 135 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  40.54 
 
 		 198 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35.25 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  43.9 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  34.26 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  44.12 
 
 		 81 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  38.36 
 
 		 81 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 90 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  37.04 
 
 		 55 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  37.25 
 
 		 88 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>