85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1469 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
513 aa  1025    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  48.9 
 
 
510 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  32.23 
 
 
531 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
483 aa  96.7  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
658 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  27.48 
 
 
592 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  27.37 
 
 
726 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  35.62 
 
 
536 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  37.78 
 
 
492 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  26.54 
 
 
531 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  25.38 
 
 
618 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  26.05 
 
 
727 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  30.81 
 
 
729 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  36.72 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  36.72 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
557 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  27.97 
 
 
704 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  37.28 
 
 
569 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  24.7 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  27.05 
 
 
532 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  32.79 
 
 
544 aa  67  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  24.46 
 
 
516 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  33.79 
 
 
564 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  23.09 
 
 
546 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  24.21 
 
 
516 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  28.26 
 
 
517 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  24.33 
 
 
516 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  24.21 
 
 
516 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  31.69 
 
 
557 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  29.29 
 
 
563 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  26.63 
 
 
593 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  28.24 
 
 
616 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  31.54 
 
 
608 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  27.44 
 
 
588 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  25.6 
 
 
558 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  33.93 
 
 
558 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1974  hypothetical protein  21.67 
 
 
542 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000256452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1913  glycosyl transferase family 39  29.78 
 
 
528 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  28.39 
 
 
534 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  25.43 
 
 
533 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  25.43 
 
 
533 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
553 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  31.61 
 
 
618 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  29.82 
 
 
553 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  31.25 
 
 
528 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  23.91 
 
 
575 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  32.56 
 
 
526 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  30.21 
 
 
528 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  26.71 
 
 
543 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  33.33 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  29 
 
 
506 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
560 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1856  hypothetical protein  34.33 
 
 
596 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837751  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  26.38 
 
 
512 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1830  hypothetical protein  34.33 
 
 
596 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
543 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  33.61 
 
 
549 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  31.19 
 
 
2073 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  25 
 
 
507 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
553 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  28.16 
 
 
565 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.97 
 
 
780 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  26.56 
 
 
526 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  30.37 
 
 
541 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  30.69 
 
 
546 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  33.33 
 
 
541 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  30.69 
 
 
546 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0974  hypothetical protein  30.43 
 
 
501 aa  47  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  28.79 
 
 
522 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  28.79 
 
 
522 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14261  glycosyltransferase  30.19 
 
 
555 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.259667  hitchhiker  0.00324745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  31.11 
 
 
638 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  27.02 
 
 
547 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  36.23 
 
 
561 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  31.33 
 
 
557 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  38.75 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  26.04 
 
 
540 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  31.33 
 
 
557 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2568  hypothetical protein  23.41 
 
 
510 aa  44.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.777888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1036  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  30.43 
 
 
757 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2778  hypothetical protein  24.15 
 
 
513 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2637  hypothetical protein  22.52 
 
 
516 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
541 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0479  hypothetical protein  26.92 
 
 
486 aa  43.5  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.318642 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  27.08 
 
 
509 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>