109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1431 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  100 
 
 
165 aa  331  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  45.45 
 
 
171 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  44.85 
 
 
171 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  44.24 
 
 
171 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  40 
 
 
171 aa  145  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  44.79 
 
 
166 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  42.86 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  39.16 
 
 
173 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  40.7 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  40.37 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  40.37 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  42.26 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  40.61 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.59 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  32.92 
 
 
164 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  31.06 
 
 
158 aa  100  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  36.09 
 
 
168 aa  100  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  36.31 
 
 
168 aa  97.4  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.71 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  32.92 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  33.33 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.16 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  32.53 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  32.53 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.42 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  28.28 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  36.31 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.53 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.22 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  36.69 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.57 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  29.24 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.52 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  27.37 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.44 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  33.56 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  35.25 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  33.57 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  32.28 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  32.28 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  32.48 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  29.71 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.1 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  31.48 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.48 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  35.21 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.06 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.86 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.88 
 
 
180 aa  51.2  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.88 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  27.87 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  31.43 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  31.91 
 
 
163 aa  50.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  27.45 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  27.81 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  29.63 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  33.33 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.41 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.57 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  29.82 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  33.76 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.57 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.71 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.63 
 
 
172 aa  47.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.81 
 
 
168 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  26.09 
 
 
225 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 
175 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
182 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  25.97 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  31.17 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.62 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.79 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  26.8 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.36 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  28.98 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.29 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.34 
 
 
170 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.5 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  29.63 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.57 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  34.03 
 
 
160 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  31.98 
 
 
157 aa  43.9  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 
181 aa  43.9  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  28.24 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  28.24 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  30.14 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  25.32 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  29.86 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  28.27 
 
 
240 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>