More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1407 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  73.17 
 
 		 651 aa  981    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 656 aa  1350    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  55.67 
 
 		 804 aa  648    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  53.67 
 
 		 642 aa  690    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  54.11 
 
 		 645 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 		 654 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  52.81 
 
 		 638 aa  667    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  55.95 
 
 		 635 aa  706    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.22 
 
 		 643 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  55.63 
 
 		 796 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.66 
 
 		 640 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.05 
 
 		 640 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  52.99 
 
 		 661 aa  652    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  53.03 
 
 		 649 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  51.04 
 
 		 657 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  52.17 
 
 		 648 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 		 640 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  51.07 
 
 		 636 aa  651    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 		 640 aa  659    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  50.21 
 
 		 720 aa  638    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  48.47 
 
 		 635 aa  635    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.66 
 
 		 640 aa  663    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  52.19 
 
 		 651 aa  670    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  52.73 
 
 		 636 aa  704    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  58.32 
 
 		 635 aa  722    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  55.39 
 
 		 802 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  52.46 
 
 		 661 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  54.5 
 
 		 655 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  71.04 
 
 		 665 aa  987    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 		 636 aa  708    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  59.39 
 
 		 633 aa  780    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  54.26 
 
 		 645 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  54.35 
 
 		 658 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.47 
 
 		 644 aa  713    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  56.64 
 
 		 644 aa  735    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 		 644 aa  682    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  55.08 
 
 		 655 aa  697    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  52.96 
 
 		 637 aa  679    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  55.05 
 
 		 655 aa  697    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  53.8 
 
 		 650 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  56.27 
 
 		 645 aa  683    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  50.68 
 
 		 634 aa  636    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 		 640 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  50.8 
 
 		 695 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.42 
 
 		 640 aa  734    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  53.59 
 
 		 655 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  55.51 
 
 		 645 aa  683    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 		 640 aa  659    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  48.41 
 
 		 634 aa  644    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.5 
 
 		 634 aa  709    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 		 645 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.82 
 
 		 640 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  53.97 
 
 		 679 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.42 
 
 		 641 aa  700    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  67.61 
 
 		 675 aa  933    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 		 652 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  53.45 
 
 		 655 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  48.99 
 
 		 714 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  56.84 
 
 		 632 aa  763    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.5 
 
 		 649 aa  647    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.81 
 
 		 633 aa  729    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 		 644 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.77 
 
 		 642 aa  746    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  56.2 
 
 		 644 aa  741    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  52.62 
 
 		 719 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  55.97 
 
 		 794 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  51.82 
 
 		 652 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  55.1 
 
 		 638 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.95 
 
 		 638 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  50.72 
 
 		 675 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  66.71 
 
 		 708 aa  969    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.52 
 
 		 633 aa  719    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  53.29 
 
 		 627 aa  686    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50.3 
 
 		 646 aa  656    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  52.42 
 
 		 651 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  55.82 
 
 		 645 aa  680    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 		 640 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  52.29 
 
 		 637 aa  699    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  50.61 
 
 		 650 aa  654    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  53.31 
 
 		 651 aa  696    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  53.33 
 
 		 643 aa  698    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54.49 
 
 		 640 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  51.02 
 
 		 696 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  59.42 
 
 		 628 aa  781    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  55.97 
 
 		 796 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.05 
 
 		 640 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  53.17 
 
 		 666 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 		 640 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  54.71 
 
 		 802 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  53.87 
 
 		 643 aa  698    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  54.46 
 
 		 641 aa  685    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.26 
 
 		 642 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  55.18 
 
 		 638 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.69 
 
 		 642 aa  666    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  53.89 
 
 		 642 aa  687    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  48.72 
 
 		 650 aa  640    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 		 653 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  53.45 
 
 		 655 aa  693    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  53.45 
 
 		 655 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  54.49 
 
 		 655 aa  706    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>