123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1333 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  815    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  63.82 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  62.19 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  61.25 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  62.94 
 
 		 403 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  58.81 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  47.63 
 
 		 400 aa  348  8e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  43.98 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  46.88 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  46 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  44.86 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  46.5 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  40.66 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  42.7 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  37.76 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  37.69 
 
 		 443 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  36.24 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  35.71 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  33.67 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  33.59 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  33.51 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  35.06 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  33.25 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  32.84 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  33.41 
 
 		 882 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  32.52 
 
 		 582 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  30.99 
 
 		 752 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  29.35 
 
 		 572 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  26.93 
 
 		 750 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  26.68 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  27.08 
 
 		 762 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  29.95 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  29.68 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  31.47 
 
 		 752 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.13 
 
 		 757 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  30.75 
 
 		 756 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  28.21 
 
 		 575 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  30.95 
 
 		 844 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  30.72 
 
 		 763 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  30.92 
 
 		 769 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  30.92 
 
 		 766 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  30.72 
 
 		 763 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  30.72 
 
 		 716 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  24.76 
 
 		 746 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  30.72 
 
 		 763 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  28.12 
 
 		 580 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  32.16 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  30.57 
 
 		 745 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  27.05 
 
 		 749 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  30.26 
 
 		 745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  30.26 
 
 		 745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  30.13 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  29.31 
 
 		 745 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  29.68 
 
 		 745 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25.29 
 
 		 769 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  30.9 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.61 
 
 		 572 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  29.67 
 
 		 650 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 649 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 649 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  29.08 
 
 		 649 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  28.01 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  27.62 
 
 		 649 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  27.62 
 
 		 649 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  28.9 
 
 		 649 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  27.76 
 
 		 649 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  28.27 
 
 		 649 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  27.33 
 
 		 649 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  27.83 
 
 		 649 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  30.25 
 
 		 585 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  27.88 
 
 		 635 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  29.79 
 
 		 555 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  27.89 
 
 		 566 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  27.2 
 
 		 628 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  28.74 
 
 		 647 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  26 
 
 		 727 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  27.94 
 
 		 736 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  27.12 
 
 		 630 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  27.85 
 
 		 573 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  29.38 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  27.09 
 
 		 669 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  27.3 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  28.53 
 
 		 647 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  28.07 
 
 		 641 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  28.27 
 
 		 607 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  33.45 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  28.81 
 
 		 604 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  26.68 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  25.61 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  26.32 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  24.26 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  25.86 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  27.7 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  26.3 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  25.18 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  26.29 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  25.18 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  25.61 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  30.15 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>