More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1312 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1069 aa  2160    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.43 
 
 		 1694 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 4079 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 927 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1138 aa  331  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.31 
 
 		 1979 aa  318  5e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 1276 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1049 aa  284  6.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 1073 aa  282  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 543 aa  253  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 		 1056 aa  251  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1056 aa  248  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 602 aa  238  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 562 aa  229  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 		 1067 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 878 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 1056 aa  218  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.67 
 
 		 1022 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.36 
 
 		 564 aa  209  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 		 988 aa  207  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1676 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.42 
 
 		 2240 aa  205  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 1297 aa  194  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 		 818 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 		 810 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.29 
 
 		 635 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.63 
 
 		 1013 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.87 
 
 		 576 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.16 
 
 		 2059 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 784 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 		 750 aa  173  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.06 
 
 		 573 aa  173  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.97 
 
 		 784 aa  171  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 804 aa  167  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 591 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 366 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 565 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 		 1737 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 465 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 711 aa  157  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.4 
 
 		 745 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.73 
 
 		 707 aa  154  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 935 aa  151  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 617 aa  149  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.85 
 
 		 732 aa  148  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 955 aa  148  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.16 
 
 		 397 aa  147  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 687 aa  147  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 467 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  24.41 
 
 		 1213 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 4489 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.3 
 
 		 436 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.19 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 632 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 747 aa  138  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 329 aa  138  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  27.7 
 
 		 331 aa  137  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 344 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.05 
 
 		 643 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1094 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 740 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  23.79 
 
 		 614 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 402 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 425 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.39 
 
 		 1007 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 279 aa  132  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 409 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 594 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 3035 aa  131  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.84 
 
 		 936 aa  131  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 3172 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 589 aa  128  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  24.76 
 
 		 864 aa  127  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 		 648 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 486 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 883 aa  125  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 512 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 620 aa  125  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.38 
 
 		 2145 aa  124  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 414 aa  124  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1192 aa  124  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 621 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 395 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 		 314 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.33 
 
 		 883 aa  122  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.58 
 
 		 795 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.03 
 
 		 620 aa  122  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 523 aa  122  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 409 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 634 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 649 aa  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 393 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 605 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 435 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 		 519 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 689 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 409 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 934 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 465 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.39 
 
 		 626 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>