46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1309 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  260  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  72.52 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  65.12 
 
 		 130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  65.62 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  66.14 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  61.42 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  51.18 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  56.2 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  54.55 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  46.88 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  46.88 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  46.88 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  46.88 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  55.68 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  42.52 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  47.92 
 
 		 563 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  38.1 
 
 		 580 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  39.09 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  42.71 
 
 		 652 aa  84.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  36.22 
 
 		 576 aa  83.6  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  45.74 
 
 		 580 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  39.67 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  36.22 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  38.4 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  45.74 
 
 		 580 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  36.22 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  36.22 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  36.22 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  40.35 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  33.06 
 
 		 563 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  36.46 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  43.18 
 
 		 150 aa  66.6  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  34.74 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  37.5 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  36.46 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  37.8 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  32.63 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  28.42 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  34.75 
 
 		 599 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  26.67 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>