More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1308 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 
390 aa  786    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  70.77 
 
 
389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  68.56 
 
 
386 aa  553  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  68.83 
 
 
387 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  61.82 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  57.29 
 
 
404 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  55.74 
 
 
403 aa  425  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  55.62 
 
 
405 aa  418  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  53.58 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  54.79 
 
 
405 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  53.55 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  52.88 
 
 
413 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  52.86 
 
 
415 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  53.07 
 
 
410 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  56.8 
 
 
412 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  55.16 
 
 
436 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  51.77 
 
 
412 aa  371  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  52.22 
 
 
410 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  50.14 
 
 
407 aa  365  1e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  55.36 
 
 
394 aa  363  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  50.53 
 
 
407 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  50.53 
 
 
407 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 
407 aa  362  6e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  54.82 
 
 
407 aa  362  8e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  51.69 
 
 
406 aa  361  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  52.37 
 
 
412 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  49.61 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  50.84 
 
 
431 aa  355  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  50.41 
 
 
407 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  53.98 
 
 
404 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  49.3 
 
 
426 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  49.58 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  48.35 
 
 
422 aa  334  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  48.59 
 
 
379 aa  333  4e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  46.01 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  47.63 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  44.71 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  44.54 
 
 
405 aa  306  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  43.95 
 
 
402 aa  305  8.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  45.9 
 
 
421 aa  300  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  48.72 
 
 
450 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  44.48 
 
 
446 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  49.31 
 
 
425 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  43.45 
 
 
443 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  43.45 
 
 
460 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  46.25 
 
 
389 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  47.08 
 
 
429 aa  297  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  50.56 
 
 
284 aa  294  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  45.15 
 
 
465 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  41.8 
 
 
393 aa  292  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  39.04 
 
 
464 aa  290  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  47.45 
 
 
447 aa  290  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  51.1 
 
 
443 aa  286  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  47.65 
 
 
398 aa  286  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  45.1 
 
 
400 aa  285  9e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  42.61 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  45.78 
 
 
416 aa  282  8.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  41.16 
 
 
403 aa  280  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  42.94 
 
 
427 aa  280  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  39.89 
 
 
417 aa  276  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  44.78 
 
 
410 aa  271  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  41.94 
 
 
414 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  46.02 
 
 
431 aa  270  5e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  44.17 
 
 
422 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.38 
 
 
732 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.16 
 
 
769 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.32 
 
 
719 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.74 
 
 
723 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.41 
 
 
768 aa  251  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.28 
 
 
731 aa  251  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.35 
 
 
735 aa  251  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  48.87 
 
 
764 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.57 
 
 
731 aa  247  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.39 
 
 
727 aa  246  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.81 
 
 
718 aa  246  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.2 
 
 
781 aa  245  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.62 
 
 
800 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.82 
 
 
739 aa  245  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.37 
 
 
738 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.62 
 
 
759 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.07 
 
 
737 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.59 
 
 
731 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.79 
 
 
510 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.85 
 
 
781 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.85 
 
 
784 aa  242  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.04 
 
 
713 aa  242  7e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  48.02 
 
 
775 aa  242  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.58 
 
 
731 aa  242  7e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.92 
 
 
760 aa  242  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.7 
 
 
738 aa  242  9e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  46.79 
 
 
763 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.39 
 
 
742 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.96 
 
 
737 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.69 
 
 
736 aa  240  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.63 
 
 
730 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.41 
 
 
810 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.17 
 
 
754 aa  237  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  49.13 
 
 
722 aa  237  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.79 
 
 
754 aa  236  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.56 
 
 
715 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>