28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1304 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  51.76 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  37.43 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 183 aa  94.4  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  38.41 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  34.36 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  31.93 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  32.92 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  34.53 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  27.64 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>