236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1291 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  63.04 
 
 		 184 aa  231  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 184 aa  217  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  48.04 
 
 		 179 aa  158  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  41.08 
 
 		 179 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 179 aa  144  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  39.67 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 202 aa  98.2  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 185 aa  88.2  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  35.78 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.63 
 
 		 888 aa  61.6  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  30.71 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.37 
 
 		 877 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  29.08 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  34.86 
 
 		 458 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  27.97 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  28.37 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  31.39 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  31.16 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  32.43 
 
 		 454 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  30.33 
 
 		 462 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.13 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  29.93 
 
 		 464 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  29.92 
 
 		 457 aa  54.7  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  32.74 
 
 		 468 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  29.92 
 
 		 457 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  30.09 
 
 		 463 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  30.09 
 
 		 456 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  31.86 
 
 		 455 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  30.28 
 
 		 464 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  29.92 
 
 		 457 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.08 
 
 		 888 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  29.2 
 
 		 464 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  28.47 
 
 		 457 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  29.2 
 
 		 464 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  29.2 
 
 		 464 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  24.82 
 
 		 875 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 455 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.77 
 
 		 845 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  33.03 
 
 		 454 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  29.2 
 
 		 463 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  28.83 
 
 		 456 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  30.97 
 
 		 456 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  28.35 
 
 		 459 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 406 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  27.74 
 
 		 875 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  29.46 
 
 		 464 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  46.43 
 
 		 465 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  28.07 
 
 		 140 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  31.86 
 
 		 456 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  26.23 
 
 		 863 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  27.43 
 
 		 453 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.81 
 
 		 892 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 382 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  48.5  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.53 
 
 		 459 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  27.01 
 
 		 875 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  29.36 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  29.66 
 
 		 463 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  25.56 
 
 		 382 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  29.32 
 
 		 769 aa  47.8  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  27.87 
 
 		 282 aa  47.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  27.87 
 
 		 880 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.78 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  27.78 
 
 		 281 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  32.06 
 
 		 465 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  51.11 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  28.66 
 
 		 394 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.97 
 
 		 455 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.94 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.78 
 
 		 465 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  30.84 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.79 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.16 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  25.95 
 
 		 909 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  27.12 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 65 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  30.16 
 
 		 459 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1622  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 100 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2252  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00411497  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.43 
 
 		 461 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  25.81 
 
 		 660 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.43 
 
 		 461 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  29.41 
 
 		 863 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 118 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  26.71 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  27.98 
 
 		 385 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  26.95 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>