132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1212 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  49.1 
 
 
1361 aa  1118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  100 
 
 
1279 aa  2516  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  42.45 
 
 
769 aa  263  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.72 
 
 
1821 aa  164  8e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  25.36 
 
 
1300 aa  156  3e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  29.02 
 
 
4630 aa  149  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  31.79 
 
 
675 aa  145  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  27.75 
 
 
1202 aa  139  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.36 
 
 
448 aa  139  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  26.2 
 
 
1281 aa  138  6e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  33.33 
 
 
560 aa  137  1e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  31.76 
 
 
1001 aa  135  7e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  32.83 
 
 
938 aa  134  1e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  26.78 
 
 
892 aa  128  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  26.27 
 
 
1316 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  29.38 
 
 
403 aa  121  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  28.7 
 
 
728 aa  120  1e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  28.43 
 
 
1042 aa  114  2e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.19 
 
 
669 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  28.42 
 
 
799 aa  110  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  28.2 
 
 
960 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.03 
 
 
658 aa  105  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  28.35 
 
 
685 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  29.35 
 
 
713 aa  103  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  28.61 
 
 
379 aa  102  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  28.18 
 
 
581 aa  102  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.95 
 
 
752 aa  102  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.81443e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.45 
 
 
2042 aa  101  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  26.28 
 
 
815 aa  99.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  32.04 
 
 
572 aa  98.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  26.38 
 
 
905 aa  94.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  39.64 
 
 
688 aa  90.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  27.36 
 
 
1180 aa  87  2e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  37.82 
 
 
171 aa  86.7  3e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  27.65 
 
 
996 aa  86.3  3e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  1.0419e-05  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.74 
 
 
971 aa  86.3  4e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  26.38 
 
 
374 aa  85.5  6e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  25.72 
 
 
1976 aa  85.5  7e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.74 
 
 
2122 aa  85.1  8e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  26.28 
 
 
331 aa  83.6  2e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  26.13 
 
 
1009 aa  82.4  5e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  25.06 
 
 
2795 aa  82  7e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.28 
 
 
2638 aa  82  7e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  34.09 
 
 
981 aa  79  6e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  77.4  2e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.25 
 
 
1732 aa  77.4  2e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  26.4 
 
 
399 aa  75.9  5e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.53391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  28.76 
 
 
575 aa  75.5  7e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  27.42 
 
 
466 aa  75.1  8e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  37.61 
 
 
910 aa  75.1  8e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.68 
 
 
570 aa  73.9  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  26.42 
 
 
679 aa  73.6  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  49.23 
 
 
517 aa  72.4  5e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  25.49 
 
 
449 aa  70.1  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  31.45 
 
 
575 aa  69.7  4e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  29.66 
 
 
631 aa  68.9  6e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  31.46 
 
 
1783 aa  67  2e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  32.4 
 
 
373 aa  67.4  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  29.66 
 
 
926 aa  65.9  6e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  27.8 
 
 
1048 aa  64.7  1e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  30.9 
 
 
332 aa  63.9  2e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  29.7 
 
 
656 aa  63.9  2e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  30.73 
 
 
437 aa  63.9  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  29.41 
 
 
416 aa  63.2  3e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  24.74 
 
 
657 aa  61.2  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.19 
 
 
1776 aa  60.5  2e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  26.11 
 
 
940 aa  60.1  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  29.87 
 
 
472 aa  60.8  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1208  calcium-binding outer membrane-like protein  29.15 
 
 
331 aa  60.5  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  26.32 
 
 
390 aa  60.5  2e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.21445e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  44.59 
 
 
126 aa  60.1  3e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  28.5 
 
 
472 aa  59.7  4e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  32 
 
 
405 aa  58.9  6e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  7.82574e-10  normal 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  28.78 
 
 
747 aa  58.5  7e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  29.57 
 
 
332 aa  58.5  7e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  25.85 
 
 
1096 aa  58.5  8e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  32.03 
 
 
586 aa  58.2  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  35.24 
 
 
525 aa  57  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  25.15 
 
 
466 aa  57.4  2e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4108  hypothetical protein  28.04 
 
 
296 aa  56.6  3e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  36.69 
 
 
316 aa  56.2  4e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  28.88 
 
 
656 aa  55.8  5e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  27.21 
 
 
730 aa  55.1  9e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.42777e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  24.6 
 
 
329 aa  54.7  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  32 
 
 
841 aa  54.7  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  29.63 
 
 
1021 aa  54.3  2e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  28.65 
 
 
462 aa  53.9  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  25.4 
 
 
514 aa  53.9  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  31.4 
 
 
1937 aa  53.1  3e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  31.4 
 
 
1467 aa  53.1  3e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  22.5 
 
 
819 aa  52.8  4e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.63 
 
 
2552 aa  52  6e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  31.06 
 
 
197 aa  52  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  31.06 
 
 
197 aa  52  8e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  25.67 
 
 
2296 aa  51.6  9e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  30.97 
 
 
882 aa  51.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  27.91 
 
 
220 aa  50.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  32.72 
 
 
201 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  25.4 
 
 
2358 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  3.73637e-09 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  29.55 
 
 
635 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>