13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1171 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1171  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  912    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000157605  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1284  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.6 
 
 		 375 aa  47.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 620 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 612 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 4079 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.77 
 
 		 620 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 639 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 828 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>