227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1159 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  54.29 
 
 		 995 aa  1074    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  38.06 
 
 		 1058 aa  659    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 1036 aa  2113    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  34.32 
 
 		 950 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  29.98 
 
 		 1020 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.07 
 
 		 836 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  41.92 
 
 		 1299 aa  353  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1154 aa  343  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.18 
 
 		 974 aa  299  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1147 aa  289  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1426 aa  273  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1177 aa  264  8e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1338 aa  261  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  28.61 
 
 		 1076 aa  259  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  33.12 
 
 		 1159 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1209 aa  219  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  32.48 
 
 		 1244 aa  214  9e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  31.51 
 
 		 1257 aa  213  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1120 aa  204  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.45 
 
 		 795 aa  193  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  30.32 
 
 		 410 aa  177  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1612 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  29.51 
 
 		 1132 aa  172  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  29.75 
 
 		 1432 aa  131  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.31 
 
 		 416 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0993  hypothetical protein  24.74 
 
 		 826 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  29.59 
 
 		 684 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  26.94 
 
 		 518 aa  118  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2211  hypothetical protein  41.98 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00033176  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.29 
 
 		 1170 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  29.08 
 
 		 629 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  23.17 
 
 		 1256 aa  110  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1166  hypothetical protein  94.83 
 
 		 60 aa  108  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25.89 
 
 		 557 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.47 
 
 		 1041 aa  105  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.46 
 
 		 562 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1178 aa  105  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  26.11 
 
 		 404 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.54 
 
 		 1252 aa  100  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  28.32 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  29.18 
 
 		 816 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  32.16 
 
 		 247 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1104 aa  93.2  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1195 aa  93.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.43 
 
 		 1194 aa  87  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1581 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.64 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  27.07 
 
 		 493 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1125 aa  83.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  25.74 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  22.11 
 
 		 1189 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  23.3 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1231 aa  77.4  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.49 
 
 		 1002 aa  76.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  21.98 
 
 		 1180 aa  72  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  34.91 
 
 		 1186 aa  72  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  23.38 
 
 		 1167 aa  71.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  22.51 
 
 		 1022 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1210 aa  71.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  27.88 
 
 		 523 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1440 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  21.01 
 
 		 612 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  20.65 
 
 		 746 aa  69.3  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1209 aa  69.7  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1338 aa  68.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  34.55 
 
 		 389 aa  67.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1231 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1422 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  22.44 
 
 		 1144 aa  65.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 846 aa  65.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  35.24 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1016 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1282 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  27.6 
 
 		 478 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1339 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1461 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1366 aa  62.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  23.49 
 
 		 1160 aa  62  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1088 aa  61.6  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1243 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  25.21 
 
 		 1306 aa  61.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1347 aa  60.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.29 
 
 		 1319 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1441 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 504 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  24.65 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  23.54 
 
 		 1318 aa  60.1  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1452 aa  60.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  32.43 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  27.42 
 
 		 838 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  23.75 
 
 		 1338 aa  59.7  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1346 aa  59.3  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1800  hypothetical protein  21.56 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  24.63 
 
 		 1055 aa  58.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  24.25 
 
 		 1336 aa  58.2  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  22.95 
 
 		 1219 aa  58.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  23.51 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  21.93 
 
 		 1322 aa  57.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1184 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>