99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1117 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  69.48 
 
 		 213 aa  314  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  38.5 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  43.23 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  39.47 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  44.77 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  45.03 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  48.34 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  41.51 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  22.86 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  32.29 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  37.16 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  37.39 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  38.21 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  31.89 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  36.64 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  27.27 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  36.07 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  32.89 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1630  hypothetical protein  32.69 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  32.58 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  28.25 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  32.26 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  37.23 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  29.84 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  31.47 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  33.07 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  32.33 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  32.81 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.54 
 
 		 854 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  28.29 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.3 
 
 		 845 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  30.66 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  25.68 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  23.53 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  27.21 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0210  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.11 
 
 		 810 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  23.97 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  23.29 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.91 
 
 		 814 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  23.29 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  22.6 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  22.6 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  23.53 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  28.67 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  24.43 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  26.22 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  30.43 
 
 		 784 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  27.45 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1306  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  34 
 
 		 810 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927981  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0501  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27 
 
 		 772 aa  47  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2358  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.31 
 
 		 818 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0780657  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  27.81 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2494  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.93 
 
 		 795 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0476201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.05 
 
 		 780 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.17 
 
 		 820 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.86 
 
 		 859 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400508  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  31.17 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.82 
 
 		 801 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00584126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  25.19 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  33.68 
 
 		 827 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25640  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  31.43 
 
 		 838 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.811582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2298  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.07 
 
 		 801 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.184232  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.18 
 
 		 807 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4536  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 807 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0718  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  35.45 
 
 		 671 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  30.37 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2408  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.18 
 
 		 830 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2609  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.58 
 
 		 799 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1309  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.99 
 
 		 799 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2238  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.58 
 
 		 799 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39329  normal  0.0221267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.97 
 
 		 807 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0444  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.09 
 
 		 803 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6081  Phenylalanine--tRNA ligase  28 
 
 		 838 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0047  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.09 
 
 		 802 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0677  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.09 
 
 		 801 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3057  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.09 
 
 		 827 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4271  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 810 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1683  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.13 
 
 		 803 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3487  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.09 
 
 		 808 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2315  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.23 
 
 		 803 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507205  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2048  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.68 
 
 		 795 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0209  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.26 
 
 		 807 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.212777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.91 
 
 		 839 aa  42.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1416  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.26 
 
 		 801 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0211445  normal  0.563013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.26 
 
 		 791 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.86 
 
 		 794 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0212  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.91 
 
 		 802 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5464  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.58 
 
 		 825 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1729  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30 
 
 		 795 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.57 
 
 		 859 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.69 
 
 		 792 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_310  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.55 
 
 		 809 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.91 
 
 		 801 aa  41.6  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.263135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  25.69 
 
 		 792 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.18 
 
 		 803 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>