64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1074 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  543  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.64 
 
 
267 aa  297  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.37 
 
 
265 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.96 
 
 
263 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  43.17 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.96 
 
 
282 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.83 
 
 
261 aa  146  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.96 
 
 
268 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  33.08 
 
 
268 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.46 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.47 
 
 
260 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.5 
 
 
260 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  27 
 
 
259 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  26.62 
 
 
259 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.42 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.42 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  27.76 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.46 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1264  hypothetical protein  41.55 
 
 
162 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0238367  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.92 
 
 
264 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.44 
 
 
254 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1263  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.54 
 
 
117 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.2 
 
 
356 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  31.25 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1283  hypothetical protein  51.47 
 
 
75 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.79 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.85 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  20.23 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.36 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
368 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
589 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  34.25 
 
 
390 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.75 
 
 
55 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.81 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
367 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  30.08 
 
 
414 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  32.26 
 
 
340 aa  45.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.51 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  32.91 
 
 
615 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.51 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.69 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
57 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.8 
 
 
667 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.22 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  34.94 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  22.01 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.66 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46 
 
 
56 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.94 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3612  NIL domain-containing protein  27.84 
 
 
134 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0684282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 
365 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
369 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  41.67 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  39.62 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  31.88 
 
 
379 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
368 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  34.29 
 
 
345 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  30.49 
 
 
616 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.67 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  34.62 
 
 
392 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  31.75 
 
 
315 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.59 
 
 
228 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 
620 aa  42  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>