154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1039 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  69.86 
 
 
209 aa  296  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  62.68 
 
 
209 aa  282  2e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  61.24 
 
 
209 aa  261  7e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  54.55 
 
 
209 aa  247  9e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0765  phosphate transport regulator-like protein  43.06 
 
 
209 aa  193  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.360674  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  43.63 
 
 
206 aa  164  1e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  43.63 
 
 
205 aa  163  2e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  39.07 
 
 
217 aa  163  2e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  42.65 
 
 
205 aa  162  4e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  43.14 
 
 
205 aa  162  5e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  41.67 
 
 
205 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  40.76 
 
 
213 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  40.2 
 
 
204 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  39.71 
 
 
209 aa  155  5e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  40.69 
 
 
205 aa  155  5e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  39.22 
 
 
219 aa  155  5e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  39.22 
 
 
209 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1024  phosphate transport regulator-like  37.14 
 
 
210 aa  154  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  38.86 
 
 
211 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  38.39 
 
 
211 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  38.39 
 
 
211 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  37.44 
 
 
211 aa  138  5e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  36.97 
 
 
213 aa  138  5e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  38.65 
 
 
205 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  39.42 
 
 
209 aa  137  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  36.1 
 
 
282 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  35.78 
 
 
205 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  35.15 
 
 
208 aa  134  1e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  37.93 
 
 
208 aa  134  1e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  37.93 
 
 
208 aa  134  1e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  33.96 
 
 
214 aa  134  1e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  38.61 
 
 
208 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  37.44 
 
 
208 aa  131  7e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  8e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  130  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  35.96 
 
 
208 aa  130  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  35.96 
 
 
208 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  35.47 
 
 
208 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  35.96 
 
 
208 aa  129  4e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  33.82 
 
 
205 aa  129  4e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  35.96 
 
 
208 aa  129  5e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  35.96 
 
 
208 aa  129  5e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  35.96 
 
 
208 aa  129  5e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  35.71 
 
 
214 aa  127  9e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  34.8 
 
 
205 aa  127  1e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  34.98 
 
 
208 aa  127  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  35.24 
 
 
209 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  34.98 
 
 
208 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  35.24 
 
 
215 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  32.86 
 
 
215 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  34.8 
 
 
207 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  35.24 
 
 
215 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  34.98 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  43.78 
 
 
204 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.50489e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  35.61 
 
 
206 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  33.81 
 
 
215 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  35 
 
 
210 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  32.84 
 
 
205 aa  121  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  30.58 
 
 
212 aa  120  1e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  30.95 
 
 
215 aa  119  2e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  120  2e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.93859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  34.48 
 
 
208 aa  119  2e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.02331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  120  2e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.52491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  31.9 
 
 
215 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  119  4e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.80581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  119  4e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  119  4e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  119  4e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12847e-09 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  36.87 
 
 
206 aa  118  5e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  36.87 
 
 
206 aa  118  5e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  118  8e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  35.96 
 
 
206 aa  117  8e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  34.63 
 
 
210 aa  118  8e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  33.81 
 
 
215 aa  117  1e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  34.29 
 
 
215 aa  117  1e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  34.63 
 
 
210 aa  117  1e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  32.68 
 
 
206 aa  117  1e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  32.38 
 
 
215 aa  117  2e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  31.66 
 
 
209 aa  116  2e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  33.17 
 
 
205 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  37.06 
 
 
204 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  33.81 
 
 
215 aa  115  4e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  30.1 
 
 
211 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  32.38 
 
 
215 aa  111  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  37.19 
 
 
203 aa  110  1e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  27.96 
 
 
211 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  30.88 
 
 
205 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  32.68 
 
 
206 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>