197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1030 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 1139 aa  2203    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  30.45 
 
 		 1133 aa  335  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.1 
 
 		 510 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.51 
 
 		 1343 aa  190  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.89 
 
 		 958 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  32.36 
 
 		 959 aa  163  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1094 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1224 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.68 
 
 		 1412 aa  159  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.22 
 
 		 1438 aa  154  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.62 
 
 		 490 aa  154  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  35.93 
 
 		 1148 aa  142  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  32.22 
 
 		 493 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.93 
 
 		 395 aa  121  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.25 
 
 		 546 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1181 aa  118  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.08 
 
 		 524 aa  111  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.44 
 
 		 644 aa  108  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.86 
 
 		 501 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.03 
 
 		 192 aa  95.5  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  37.13 
 
 		 431 aa  93.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.19 
 
 		 1328 aa  92  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.86 
 
 		 667 aa  92  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.97 
 
 		 666 aa  89  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.29 
 
 		 157 aa  89  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.56 
 
 		 1041 aa  88.6  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.74 
 
 		 302 aa  87.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.51 
 
 		 399 aa  86.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.89 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.43 
 
 		 670 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.94 
 
 		 831 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.63 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.02 
 
 		 323 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.88 
 
 		 180 aa  77.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.09 
 
 		 390 aa  77.4  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.67 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.22 
 
 		 157 aa  72.8  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.86 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 208 aa  72  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.24 
 
 		 1110 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.97 
 
 		 214 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.25 
 
 		 641 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.83 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.81 
 
 		 224 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.2 
 
 		 200 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  40.62 
 
 		 838 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.12 
 
 		 173 aa  65.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.48 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  28.38 
 
 		 299 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.89 
 
 		 1216 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.69 
 
 		 1194 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.69 
 
 		 400 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 593 aa  63.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.07 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.36 
 
 		 642 aa  62.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.94 
 
 		 121 aa  63.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  27.27 
 
 		 1143 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  37.07 
 
 		 199 aa  62.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  28.38 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  31.38 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.67 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  31.46 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  25.56 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  34.72 
 
 		 886 aa  61.6  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.56 
 
 		 395 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  31.72 
 
 		 428 aa  61.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.55 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.66 
 
 		 320 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.24 
 
 		 325 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.62 
 
 		 331 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.91 
 
 		 557 aa  60.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.02 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.44 
 
 		 642 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  27.56 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  28 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  29.67 
 
 		 320 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0719  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  42.5 
 
 		 423 aa  57  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.17 
 
 		 411 aa  57  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.23 
 
 		 408 aa  57  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  29.19 
 
 		 402 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.36 
 
 		 321 aa  57  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.85 
 
 		 220 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.27 
 
 		 370 aa  57  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.88 
 
 		 442 aa  56.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.09 
 
 		 223 aa  56.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5869  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 		 283 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.618301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3973  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.94 
 
 		 309 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.72 
 
 		 320 aa  55.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.4 
 
 		 150 aa  55.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.61 
 
 		 668 aa  54.3  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  28.33 
 
 		 319 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.26 
 
 		 334 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.26 
 
 		 285 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.45 
 
 		 162 aa  54.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.57 
 
 		 220 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.57 
 
 		 220 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  32.23 
 
 		 321 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>