42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0959 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  772    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  52.76 
 
 
363 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  50.71 
 
 
361 aa  360  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  47.7 
 
 
357 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  44.67 
 
 
347 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  37.53 
 
 
370 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  39.05 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  38.58 
 
 
369 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  34.86 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  35.94 
 
 
344 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  36 
 
 
355 aa  224  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  39.12 
 
 
379 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  33.52 
 
 
374 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  31.2 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  31.7 
 
 
401 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  32.96 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  28.96 
 
 
363 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  27.59 
 
 
367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  28.24 
 
 
369 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  29.77 
 
 
342 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  28.32 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  26.8 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  26.41 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  22.88 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  25.18 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  25.81 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  24.31 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  27.15 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  23.96 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  27.93 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  28.19 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  25.54 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  23.62 
 
 
860 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  23.88 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  24.22 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  24.23 
 
 
340 aa  49.7  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1450  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  24.26 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000102765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  21.81 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3629  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  26.87 
 
 
361 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3848  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  22.79 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  26.62 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>