More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0957 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
386 aa  802    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  63.64 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  55.79 
 
 
386 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  46.77 
 
 
394 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
401 aa  249  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  39.46 
 
 
396 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
421 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  41.42 
 
 
358 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  36.21 
 
 
360 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.68 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
396 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
417 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
394 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
398 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
426 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
421 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
394 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
394 aa  133  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.06 
 
 
650 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  32.35 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
435 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
355 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
422 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
672 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.92 
 
 
383 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  31.02 
 
 
428 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
439 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
448 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
424 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
365 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
409 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.92 
 
 
435 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
398 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
384 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
387 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
377 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  32.24 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
421 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.49 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.15 
 
 
423 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
536 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.77 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
364 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.03 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.93 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
374 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
423 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
382 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.09 
 
 
406 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
435 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
419 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
455 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  28.9 
 
 
418 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
381 aa  113  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.81 
 
 
443 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
413 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  29.7 
 
 
417 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
425 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  30.4 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
743 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>