41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0954 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  74.66 
 
 		 522 aa  739    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  74.31 
 
 		 517 aa  753    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 514 aa  1005    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  58.97 
 
 		 519 aa  609  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  51.57 
 
 		 525 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  38.65 
 
 		 522 aa  329  7e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  35.26 
 
 		 506 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  35.68 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 505 aa  137  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 505 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  20.34 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 511 aa  57  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 510 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  20.78 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  21.22 
 
 		 511 aa  51.6  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 586 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  22.67 
 
 		 488 aa  47.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  20.74 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  22.38 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  22.38 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  22.38 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  22.38 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  22.38 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  19.71 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2649  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 497 aa  45.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  19.42 
 
 		 586 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 		 591 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>