More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0949 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  65.75 
 
 
620 aa  840  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  72.74 
 
 
618 aa  931  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  52.77 
 
 
610 aa  645  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  71.98 
 
 
622 aa  910  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  100 
 
 
617 aa  1271  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  51.19 
 
 
604 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  42.05 
 
 
546 aa  417  1e-115  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  41.87 
 
 
546 aa  418  1e-115  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  50.77 
 
 
512 aa  419  1e-115  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
546 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  42.08 
 
 
546 aa  413  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  43.11 
 
 
549 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
547 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  48.97 
 
 
513 aa  413  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  41.71 
 
 
543 aa  402  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  37.17 
 
 
557 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
557 aa  359  1e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  35.39 
 
 
559 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.87 
 
 
557 aa  351  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
557 aa  342  1e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  41.06 
 
 
547 aa  308  2e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  41 
 
 
609 aa  300  6e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
682 aa  290  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  40.26 
 
 
545 aa  289  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  41.52 
 
 
551 aa  287  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  38.64 
 
 
749 aa  286  6e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  39.45 
 
 
628 aa  285  2e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
654 aa  284  3e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  39.39 
 
 
791 aa  281  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  41.13 
 
 
797 aa  280  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.13 
 
 
671 aa  279  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  39.85 
 
 
549 aa  278  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  39.1 
 
 
558 aa  276  1e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  40.58 
 
 
640 aa  275  2e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
1255 aa  272  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  40.22 
 
 
847 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
556 aa  271  3e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
542 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  40.71 
 
 
591 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  38.85 
 
 
831 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.36 
 
 
583 aa  265  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  37.14 
 
 
549 aa  264  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
692 aa  263  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  39.28 
 
 
1335 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
510 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  40 
 
 
1319 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  35.25 
 
 
722 aa  256  1e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.13 
 
 
519 aa  254  5e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.34 
 
 
770 aa  244  4e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
991 aa  235  2e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  42.59 
 
 
612 aa  228  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  31.76 
 
 
577 aa  214  4e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
572 aa  213  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
491 aa  204  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
492 aa  198  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
492 aa  196  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.49 
 
 
489 aa  191  3e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
548 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
544 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
552 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35.03 
 
 
552 aa  176  2e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.43 
 
 
473 aa  170  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  32 
 
 
478 aa  163  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
463 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.94 
 
 
444 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.9 
 
 
412 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
492 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  33.98 
 
 
452 aa  157  5e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
450 aa  157  5e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.84 
 
 
521 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  32.83 
 
 
498 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.95 
 
 
311 aa  155  3e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
411 aa  154  6e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.9 
 
 
440 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  34.51 
 
 
445 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
463 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  32.53 
 
 
466 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.54 
 
 
445 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  28.34 
 
 
476 aa  151  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  30.28 
 
 
438 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
467 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  33.53 
 
 
521 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
483 aa  150  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
491 aa  149  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  32.54 
 
 
432 aa  149  1e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  32.36 
 
 
492 aa  149  2e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.98 
 
 
458 aa  148  2e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
454 aa  149  2e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.26 
 
 
477 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  33.04 
 
 
482 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  34.17 
 
 
491 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  32.25 
 
 
480 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
482 aa  148  4e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
447 aa  147  4e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  2.24608e-07 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
488 aa  147  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.92 
 
 
447 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>