More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0925 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.19 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 263 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.8 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.84 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514204 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  38.34 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.6 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  39.22 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.6 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  41.9 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  41.11 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.05 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 		 261 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 		 261 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  41.9 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  43.48 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  41.11 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  41.86 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  41.11 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  41.11 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.64 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.86 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.32 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.8 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  40.71 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 293 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.8 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.85 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  37.35 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>