290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0909 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 517 aa  1038    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  28.16 
 
 		 669 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  30.53 
 
 		 713 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  29.52 
 
 		 675 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.28 
 
 		 971 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  37.16 
 
 		 1565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  38.03 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  31.88 
 
 		 859 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.65 
 
 		 930 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.15 
 
 		 735 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  27.44 
 
 		 679 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.25 
 
 		 1094 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  32.35 
 
 		 1057 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  34.26 
 
 		 752 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  35.1 
 
 		 734 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  31.66 
 
 		 2176 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.96 
 
 		 2272 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  35.17 
 
 		 1667 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  27.49 
 
 		 685 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.9 
 
 		 2554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.68 
 
 		 1842 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.59 
 
 		 861 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  32.39 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  33.33 
 
 		 1528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35.41 
 
 		 3197 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  32.25 
 
 		 1300 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.98 
 
 		 2036 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1682 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  31.68 
 
 		 1862 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.87 
 
 		 963 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.66 
 
 		 658 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  29.1 
 
 		 958 aa  126  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.3 
 
 		 1882 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.38 
 
 		 1356 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  35.76 
 
 		 3197 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  37.18 
 
 		 910 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1667 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  31.53 
 
 		 978 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  33.13 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.07 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  31.84 
 
 		 2122 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  51.68 
 
 		 1150 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1282 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  43.43 
 
 		 816 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  33.15 
 
 		 838 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  30.36 
 
 		 2000 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  28.74 
 
 		 575 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  31.47 
 
 		 1241 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.79 
 
 		 1361 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.7 
 
 		 1969 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  28.96 
 
 		 1814 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  30.87 
 
 		 941 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  30.77 
 
 		 1120 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.34 
 
 		 1387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  38.56 
 
 		 1916 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  30.3 
 
 		 1011 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  36.86 
 
 		 3295 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  30 
 
 		 560 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  34.78 
 
 		 1236 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  38.64 
 
 		 623 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  36.74 
 
 		 1732 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  30.87 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.46 
 
 		 1606 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  31.64 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.46 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  30.69 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  31.27 
 
 		 791 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 552 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  29.23 
 
 		 929 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  30.17 
 
 		 1095 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  31.02 
 
 		 1783 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.55 
 
 		 1620 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 869 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  37.38 
 
 		 2066 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.8 
 
 		 1371 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.76 
 
 		 615 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  27.67 
 
 		 792 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.3 
 
 		 865 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.25 
 
 		 769 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  37.91 
 
 		 317 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  32.34 
 
 		 1531 aa  91.3  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  29.17 
 
 		 840 aa  90.5  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.31 
 
 		 1602 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  30.91 
 
 		 650 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  29.15 
 
 		 870 aa  88.2  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  29.13 
 
 		 1162 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  29.23 
 
 		 823 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  26.95 
 
 		 719 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  26.67 
 
 		 1292 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  30.99 
 
 		 2552 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.84 
 
 		 1389 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  30.04 
 
 		 845 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  33.49 
 
 		 918 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  34.32 
 
 		 873 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  27.33 
 
 		 802 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  52.17 
 
 		 1042 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  34.2 
 
 		 930 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  29.35 
 
 		 823 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  39.69 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>