More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0852 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  100 
 
 
492 aa  984    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  58.45 
 
 
493 aa  588  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  61.86 
 
 
474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  60.57 
 
 
494 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  55.69 
 
 
492 aa  557  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  48.03 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  49.59 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  46.31 
 
 
491 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  43.24 
 
 
487 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  42.35 
 
 
481 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  41.13 
 
 
481 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  40.71 
 
 
481 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  42.38 
 
 
481 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  45.21 
 
 
497 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 
456 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  46.67 
 
 
501 aa  359  6e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  43.75 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  44.14 
 
 
554 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  43.88 
 
 
502 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1504  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 
498 aa  355  1e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 
462 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  44.71 
 
 
466 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 
479 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  44.56 
 
 
467 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  45.29 
 
 
459 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  43.82 
 
 
467 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  43.35 
 
 
473 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
466 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  39.34 
 
 
462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  44.06 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  43.78 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  39.34 
 
 
462 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  39.34 
 
 
462 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  40.48 
 
 
458 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  39.34 
 
 
462 aa  342  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  38.96 
 
 
462 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  38.74 
 
 
462 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  38.74 
 
 
462 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  44.18 
 
 
467 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  41 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  38.65 
 
 
463 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  41.65 
 
 
467 aa  339  8e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  38.74 
 
 
462 aa  339  9e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  38.95 
 
 
463 aa  338  9e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  41.14 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  42.22 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  42.64 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  40.52 
 
 
461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  42.22 
 
 
493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
463 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  42.64 
 
 
464 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  40.78 
 
 
459 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
459 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  39.48 
 
 
459 aa  335  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  39.79 
 
 
462 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  42.38 
 
 
463 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  39.43 
 
 
462 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  42.31 
 
 
464 aa  333  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
468 aa  333  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  42.52 
 
 
464 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  43.45 
 
 
471 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  40.34 
 
 
466 aa  330  3e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 
455 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 
462 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 
462 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  40.96 
 
 
461 aa  330  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
475 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  42.42 
 
 
463 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  37.01 
 
 
466 aa  329  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  42.37 
 
 
464 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  44.74 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  42.2 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  40.22 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  40.81 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  42.09 
 
 
468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  39.92 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  38.04 
 
 
504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  42.35 
 
 
469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  43.2 
 
 
478 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  42.37 
 
 
464 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  44.92 
 
 
471 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  40.26 
 
 
458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 
499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  42.09 
 
 
441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  40.61 
 
 
466 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
478 aa  326  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 
464 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 
465 aa  326  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  41.53 
 
 
464 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 
464 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  41.16 
 
 
469 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  41.81 
 
 
463 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  40.34 
 
 
458 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  42.49 
 
 
463 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
465 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  44.57 
 
 
478 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  44.39 
 
 
471 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 
467 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  39.09 
 
 
487 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>