More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0837 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
300 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  77.27 
 
 
285 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  69.58 
 
 
293 aa  401  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  67.02 
 
 
300 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  61.4 
 
 
286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 
289 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  55.24 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
284 aa  279  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  52.36 
 
 
294 aa  278  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  50.7 
 
 
282 aa  271  9e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  49.48 
 
 
282 aa  261  6.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
306 aa  260  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
288 aa  258  6e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
288 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
288 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
296 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  42.66 
 
 
292 aa  228  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  37.11 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
283 aa  181  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
285 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
284 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
286 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 
291 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
282 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 
282 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
292 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
294 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
295 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  40 
 
 
291 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
310 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  38.87 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 
289 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
297 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
294 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
294 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
285 aa  169  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
294 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
291 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
304 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
290 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
299 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
294 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 
299 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
287 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  38.85 
 
 
290 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
305 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
300 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  31 
 
 
299 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
299 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
299 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
293 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 
284 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
290 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
283 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
283 aa  151  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
283 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
332 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
284 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
283 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  34.78 
 
 
307 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
298 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
299 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
300 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
299 aa  150  3e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
223 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
331 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 
288 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
293 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
299 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
299 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
281 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>