More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0827 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  100 
 
 
440 aa  857    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  69.75 
 
 
426 aa  610  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  49.18 
 
 
427 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  46.96 
 
 
427 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  45.17 
 
 
424 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  43.15 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  43.15 
 
 
441 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  45.78 
 
 
431 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  45.27 
 
 
422 aa  352  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  43.68 
 
 
419 aa  350  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  43.93 
 
 
423 aa  350  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  44.24 
 
 
440 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  46.01 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  44.94 
 
 
441 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  44.04 
 
 
441 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  44.04 
 
 
441 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  43.6 
 
 
441 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  41.97 
 
 
421 aa  338  9e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  43.6 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  43.6 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  44.49 
 
 
441 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  43.29 
 
 
424 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  43.37 
 
 
441 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  43.6 
 
 
441 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  43.6 
 
 
441 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  43.6 
 
 
441 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  43.6 
 
 
441 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  42.44 
 
 
451 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  44.04 
 
 
444 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  44.49 
 
 
444 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  44.49 
 
 
444 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  44.49 
 
 
441 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  44.49 
 
 
444 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  44.49 
 
 
444 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  41.15 
 
 
440 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  44.27 
 
 
444 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  42.47 
 
 
423 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  43.22 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  41.99 
 
 
429 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  42.32 
 
 
431 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  41.15 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  40.57 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  44.07 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  42.25 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  42.89 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  38.67 
 
 
437 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  38.67 
 
 
437 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  41.96 
 
 
431 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  37.97 
 
 
437 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  39.77 
 
 
425 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  38.77 
 
 
417 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  39.73 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40.98 
 
 
577 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  37.56 
 
 
428 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  37.61 
 
 
428 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  35.65 
 
 
429 aa  249  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  36.08 
 
 
408 aa  249  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  37.64 
 
 
422 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  34.71 
 
 
429 aa  244  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  36.66 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  35.1 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  34.27 
 
 
967 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  34.68 
 
 
421 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.65 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  33.41 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  29.93 
 
 
424 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  29.93 
 
 
444 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  29.93 
 
 
444 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.3 
 
 
419 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.17 
 
 
422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  30.63 
 
 
445 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  29.34 
 
 
405 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  28.34 
 
 
445 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  29.5 
 
 
408 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  28.29 
 
 
428 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.17 
 
 
465 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.34 
 
 
405 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.88 
 
 
436 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  29.93 
 
 
447 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.55 
 
 
400 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  30.21 
 
 
409 aa  143  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  28.23 
 
 
401 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  29.39 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.7 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  30.11 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  27.85 
 
 
402 aa  123  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  27.94 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  28.17 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  29.44 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  29.44 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.12 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  30.23 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.1 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  24.08 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  26.92 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  27.74 
 
 
404 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  27.03 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  28.29 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  25.94 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.54 
 
 
428 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>